وی که نویسنده وبلاگ «سالهای خوب سگی‌» است، اولین بار در تاریخ ۱۲ بهمن ۱۳۸۸، توسط نیروهای اطلاعات بازداشت و به اتهام «توهین به رییس جمهوری و رهبر در وبلاگ» و «شرکت در تجمعات اعتراضی تهران» و «ارتباط با بیگانگان از طریق ارسال اخبار و گزارشات» از طرف قاضی طهماسبی رئیس شعبه یکم دادگاه انقلاب یاسوج به یک سال حبس تعزیری و پنج سال حبس تعلیقی محکوم شد.

در سال ۱۳۹۶ شعبه ۲۶ دادگاه انقلاب شهر تهران، رضا اکوانیان شاعر و فعال مدنی را به اتهام «توهین به مقدسات» از طریق سرودن شعر و «تبلیغ علیه نظام» به تحمل ۳ سال حبس تعزیری و ۴۰ ضربه شلاق محکوم کرد. 

خبرگزاری هرانا که این خبر را منتشر کرده نوشته است که آقای اکوانیان به ارتکاب مواردی متهم شده بود که نهایتا از بابت دو مورد آن یعنی «تبلیغ علیه نظام» و «توهین به امام دوازدهم شیعیان» حسب مواد ۵۰۰ و ۵۱۳ قانون مجازات اسلامی به ترتیب به تحمل ۱ سال و ۲ سال و ۴۰ ضربه شلاق تعزیری محکوم شد.

اکوانیان پیش‌تر هم  حدود ساعت ۳ نیمه شب روز یکشنبه چهارم فروردین ماه ۱۳۹۲ در پی‌ مراجعه ماموران امنیتی به محل سکونتش بازداشت و پس از تفتیش منزل، وسایل شخصی‌اش از جمله لپ‌تاپ و دست نوشته‌هایش ضبط شد. وی پس از گذشت ۱۷ روز در تاریخ ۲۱ فروردین ماه با قید وثیقه ۱۰۰ میلیون تومانی از زندان آزاد شد.

به گزارش کمیته گزارشگران حقوق بشر، اکوانیان پس از دو هفته بی‌ خبری مطلق، روز هفدهم فروردین 92 موفق به ملاقات با خانواده خود شد و بنا به اظهارات خانواده اش او در این مدت زیر فشار شدید جسمی‌ به منظور اعتراف قرار گرفته به گونه‌ای که آثار کبودی و ضرب و شتم بر روی بدنش قابل مشاهده بوده است.

رضا اکوانیان در تاریخ ۶ خرداد ٩٢ با یک احضاریه مکتوب به دادگاه انقلاب شهرستان یاسوج احضار شد. از او خواسته شد که در ساعت ٩ صبح روز ٢٧ خرداد ٩٢ جهت دفاع از اتهامات وارده به دادگاه مراجعه کند. او در تاریخ مورد نظر مراجعه کرد و پس از چند ساعت بازجویی تا تشکیل دادگاه و با قید وثیقه‌ای که پیش‌تر سپرده شده بود، مجددا آزاد شد.

دو ماه بعد و در تاریخ ٢٢ مرداد ٩٢، به دنبال تجمع اعتراض آمیزی که در مقابل مجلس شورای اسلامی و در اعتراض به سخنان بزرگواری، نماینده کهگیلویه و بویر احمد صورت گرفت، به همراه ١۵ نفر از معترضان بازداشت و توسط یک دستگاه ون مشکی به زندان اوین منتقل شدند. همگی بازداشت شدگان به استثناء رضا  اکوانیان و پسر عمویش طاهر، یک روز بعد آزاد شدند.

به گزارش کمیته گزارشگران حقوق بشر، برخی‌ از آزاد شدگان گفته‌ بودند که صدای فریاد و ناله‌های رضا اکوانیان را شنیده‌ بودند. این وبلاگ نویس و فعال مدنی در تاریخ ١٧ شهریور ٩٢ با قرار وثیقهٔ ١٠٠ میلیون تومانی از زندان اوین آزاد شد.

او پس از دریافت حکم قطعی از ایران خارج شد و اکنون در تبعید زندگی می‌کند.