او که از ابتدای انتشار روزنامه «شرق»، با این روزنامه نیز همکاری می‌کرد، مردادماه سال ۸۶  مصاحبه‌ای با «ساقی قهرمان»، شاعر ایرانی مقیم کانادا انجام داد که چاپ آن سبب توقیف روزنامه شرق شد.

گرایش‌های هم‌جنس‌خواهانه خانم قهرمان و حمایت او از هم‌جنس‌خواهان، دلیل توقیف روزنامه بود. شامگاه ۲۵ خرداد ۸۸، مجتبی پورمحسن در خانه‌اش در رشت دستگیر شد. افرادی که خود را مأمور وزارت اطلاعات معرفی ‌کردند، بدون این که دلیل بازداشت او را بگویند، کیس کامپیوتر، برخی کتاب‌ها و فیلم‌های این روزنامه‌نگار و برخی از وسایل شخصی او را با خود بردند.

پورمحسن را ابتدا سه روز در بازداشتگاه موقت نگه داشتند و در حالی که قول آزاد کردن او در قبال وثیقه را داده بودند، به زندان «لاکان» رشت منتقل کردند. پورمحسن پس از ۱۱ روز بازداشت انفرادی، به قید وثیقه آزاد شد.

او چند ماه پس از آزادی، همکاری خود را با روزنامه «فرهیختگان» آغاز کرد و در طول سال‌های اخیر در مجله ادبی «تجربه»، مقاله نوشته است.

پورمحسن در تابستان سال ۸۹ به اتهام تبلیغ علیه نظام از طریق همکاری با رادیو زمانه به یک سال حبس محکوم شد اما دادگاه حکم زندان او را به مدت چند سال به حالت تعلیق درآورد.

یکی از اتهام‌های پورمحسن، انتشار مجموعه شعر «تانگوی تک نفره» در خارج از کشور بود. وی پس از آزادی، رمان «بهار ۶۳» را منتشر کرد که پس از چند بار تجدید چاپ، جایزه منتقدان و نویسندگان مطبوعات را دریافت کرد. از این روزنامه‌نگار، نویسنده و شاعر تاکنون دو رمان، چهار مجموعه شعر و چند ترجمه منتشر شده است.

پورمحسن هم اکنون سردبیر روزنامه گیلان امروز است.