در پی اعتراضات سراسری به افزایش قیمت بنزین در آبان ماه ۱۳۹۸ هزاران نفر در ایران بازداشت شدند.

قراگوزلو روز ۲۶ آبان ماه ۱۳۹۸ در حالی که در مسیر بازگشت به منزل بود، بازداشت و به بند ۲۰۹ زندان اوین منتقل شد.

یک منبع مطلع و نزدیک به خانواده این دانشجو به «ایران‌وایر» گفته بود: «ملیکا عصر ۲۶ آبان به همراه یکی از همکلاسی‌هایش برای اطلاع از فضای جامعه به میدان انقلاب رفتند. چند دقیقه بعد از این‌که آن‌ها از همدیگر جدا شدند، موبایل ملیکا از دسترس خارج شد و تا دو روز هیچ‌کس از او خبر نداشت.»

به گفته این منبع مطلع، دو روز بعد در تاریخ ۲۸ آبان۱۳۹۸، ملیکا با خانواده‌اش تماس گرفت: «او در این تماس با گریه و حال روحی بسیار نامساعدی به خانواده‌اش می‌گوید بازداشت‌شده و در زندان اوین است.»

روز دوم آذر ماه ۱۳۹۸،  «امیر رحیمی»، رییس حراست دانشگاه علامه طباطبایی با تایید بازداشت ملیکا، درباره وضعیت دانشجویان بازداشت شده این دانشگاه به ایلنا گفت: «طبق اخبار رسمی دانشگاه علامه طباطبایی، خانم ملیکا قرا‌گوزلو بازداشت شده‌اند و چون بیمار هستند، به احتمال خیلی زیاد به زودی آزاد خواهد شد.»

این روزنامه‌نگار، ۱۰ آذر ماه با تودیع وثیقه ۶۰ میلیون تومانی از زندان اوین آزاد شد.

دادگاه قراگوزلو طی دو جلسه و در تاریخ های ۱۴ بهمن و ۲ اسفند ماه در شعبه ۲۹ دادگاه انقلاب تهران برگزار شد.

براساس حکمی که روز ۷ اسفند ماه ۱۳۹۸، به صورت شفاهی به وکیل این روزنامه‌نگار ابلاغ گفته شد، ملیکا قراگوزلو به اتهام «اجتماع و تبانی علیه امنیت کشور» به ۶ ماه حبس تعزیری محکوم شد.

قراگوزلو به حکم دادگاه بدوی اعتراض کرده و تاکنون زمانی برای برگزاری دادگاه تجدیدنظر تعیین نشده است.

آبان ماه ۱۳۹۹ و به دنبال عفو و تخفیف مجازات ۳۸۷۰ نفر از زندانیان و محکومان، خانم قراگوزلو پیش از اجرای حکم  مشمول عفو شد. در این عفو و تخفیف مجازات شامل ۱۵۷ زندانی و محکوم امنیتی نیز شده بود.

خانم قراگوزلو مجددا در تاریخ ۹ مهر ۱۴۰۱ در تهران بازداشت شد و ۲۵ آبان بدون اطلاع خانواده و وکیل از زندان به بیمارستان روانپزشکی امین آباد منتقل شد. 

۱۳ آذر ۱۴۰۱، ملیکا قراگوزلو، فعال دانشجویی زندانی، در تماسی تلفنی با مادرش اعلام کرد که شنبه شب در بیمارستان رازی امین‌آباد از سوی چند مرد مورد ضرب و جرح قرار گرفته است.

محمد علی کامفیروزی، وکیل ملیکا، به نقل از مادرش ضمن اعلام این خبر گفته این افراد قصد تزریق آمپول و بستن این فعال دانشجویی به تخت بیمارستان را داشته‌اند.

موکلم ملیکا قراگوزلو در تماس تلفنی با مادرش اعلام کرد که دیشب در بیمارستان رازی امین آباد توسط چند مرد مورد ضرب و جرح قرار گرفته.قصد آنها تزریق آمپول و بستن ملیکا قراگوزلو به تخت بوده است. موکلم گفت که در اعتراض به این کار، از دیشب در اعتصاب غذاست و دیگر تماسی نخواهد داشت. 

این فعال دانشجویی ۶۵ روز پیش بازداشت شد و ١٨ روز از بستری شدنش در بیمارستان روانپزشکی رازی امین‌آباد می‌گذرد.

به گفته وکیل ملیکا قراگوزلو، «تاکنون حداقل هفت روانشناس و روانپزشک متخصص، بر عدم امکان تحمل کیفر توسط موکلم گواهی داده‌اند.»

آقای کامفیروزی با اشاره به پیگیری‌های مستمر خود و مادر این فعال دانشجویی زندانی با مسئولان مختلف درباره وضعیتش، تداوم حبس او را «مصداق بارز نقض حقوق اساسی شهروندی و شکنجه» خوانده و مسئولان قضایی و امنیتی را مسئول بروز هرگونه اتفاقی برای او دانسته است.

خانم قره‌گوزلو روز ۲۹ آذر ۱۴۰۱ آزاد شد.