پرونده اول
در تاریخ ۳۱ خرداد ۱۳۹۶، آقای دهباشی یادداشتی خطاب به «قاضی زاده هاشمی»، وزیر وقت وزارت بهداشت جمهوری اسلامی در کانال تلگرامی خود (خشت خام) منتشر کرد که همین یادداشت موجب شکایت وزیر بهداشت از او به اتهام «تشویش اذهان عمومی» شد.

او در این یادداشت به روایت قاضی زاده هاشمی از ترور «مرتضی مطهری» انتقاداتی را وارد کرده بود و بخشی از یادداشت را نیز به وضعیت مالی وزیر بهداشت اختصاص داد. در بخشی از این یادداشت آمده است: «آنچنان که برخی وزرای ارجمند و مقامات عزیز و عالیه دولت فعلی خود به قوه محترم قضائیه اظهار داشته‌اند، بعضا دارای ثروت‌هایی بالغ بر هزار میلیارد تومان هستند. انشاالله که همه دارایی‌های ایشان و از جمله ثروت آقای وزیر معزز بهداشت ناشی از رزق حلال است. اما صرفا از باب کنجکاوی ریاضیاتی اجازه داریم که از خود بپرسیم، حتی اگر در ظرف ۳۷ سال پس از انقلاب، ایشان که معمولا شاغل در دولت بوده‌‌اند، از قبل مشاغل پاره وقت خود در بخش خصوصی، ماهی یک میلیارد تومان نیز درآمد داشتند و هیچ هم خرج نمی‌کردند اکنون نهایتا باید ۴۴۴ ملیارد تومان درآمد داشتند و هنوز بیش از ۵۵۰ملیارد تومان اختلاف حساب است؟ و اگر چنین پرسشی را پرسید باید احیانا و به دروغ متهم شود به همفکری با امثال گروهک تندروی فرقان؟»

آقای دهباشی در تاریخ ۱۳ آذر ۱۳۹۶، در خصوص این شکایت در کانال تلگرامی خود نوشته بود: «فردا بنابر شکایت آقای قاضی‌زاده هاشمی دادگاه دارم. بابت نقدی که در همین کانال تلگرام به ایشان نوشتم و سخن ایشان از دلایل ترور شهید مطهری را تحریف تاریخ دانستم. جالب این‌که آن نقد به شخص ایشان است و هیچ ربطی به وزارت یا وزیر بهداشت نداشت اما طرح دعوا از سوی آن مجموعه است!»

این مستندساز در تاریخ ۸ دی ۱۳۹۶ از محکومیت خود به ۴ ماه حبس در این پرونده خبر داد. او در یادداشتی نوشته بود در آخرین لحظات برگزاری جلسه رسیدگی به اتهامش، شعبه دادگاه تغییر کرد و حتی رای دادگاه از سوی قاضی دیگری که دفاعیات او را نشنیده است، امضا شده است.

آقای دهباشی که پس از انتخابات ۱۳۹۲ از منتقدان دولت «حسن روحانی»، رییس جمهور ایران شد، در یادداشتی پس از صدور حکم خود نوشت که زیر بار منت هیچ نارفیقی برای پس گرفتن شکایت حضرات نمی‌رود.

او نوشته بود «مجازات ۴ ماه زندان را کفاره همکاری گذشته با سیاست‌مداران متکبر که صدای خرد شدن استخوان‌های این مردم مظلوم را نشنیده و صبر شرافتمندانه آن‌ها را به حساب تدابیر رندانه خود می‌گذارند»، می‌داند.

در تاریخ ۲۹ دی ۱۳۹۷، آقای دهباشی در حساب کاربری خود در توییتر از تایید حکم چهار ماه حبس در دادگاه تجدید نظر خبر داد: «حکم ۴ماه حبس قطعی به جهت شکایت دولت (وزارت بهداشت) در باب تشویش اذهان عمومی در مرحلهٔ تجدید نظر نیز عینا تایید و به اجرای احکام ابلاغ شد.»

پرونده سوم

حسین دهباشی روز ۲۵مرداد۱۳۹۹ در صفحه توییتر خود با انتشار رونوشتی از ابلاغیه دادگاه نوشت که باید روز ۲۶مرداد در دادگاه حاضر شود.

او با شکایت وزارت اطلاعات استان تهران به «فعالیت تبلیغی علیه نظام»، «نشر اکاذیب» و «توهین به روحانیت» متهم شده بود.

حسن دهباشی دلیل احضار خود را نوشتن کتاب «تاریخ شفاهی ایران» و «غیره» عنوان کرده بود و در صفحه توییتر خود نوشت: «فردا دادگاه اینجانب برای کتب تاریخ شفاهی ایران و غیره است. دلخور؟ بله! عصبانی؟ بسیار! ناامید؟ نمی‌شود ناامید بود وقتی پُشت‌سر، انبیا و اولیا و مصلحان و شهدا هستند و پیشِ‌رو، نسل ماه و محشرِ جوان که خدا کند چشمان‌اش روشن شود به ظهور حضرت حجّت ع. محتاجِ دعایِ خیرِ شما؟ بله، لطفا.»

با این حال، این تاریخ‌پژوه توضیحی نداده که منظورش از موارد دیگر با عنوان «غیره» چیست و به چه دلیل برای نوشتن کتاب تاریخی به سه اتهام متهم شده است. 

تاریخ شفاهی و تصویری ایران معاصر مجموعه پنجاه جلدی است که هفت جلد آن به قلم حسین دهباشی از سوی «سازمان اسناد و کتابخانه ملی ایران» منتشر شده است. 

حسین دهباشی روز ۶ تیر ۱۴۰۰ درحساب شخصی خود در توییتر نوشت، حکم محکومیتش به خاطر انتقاد از عدم قرنطینه شهر قم، در دادگاه تجدیدنظر نیز تایید شده است.
او از جزییات محکومیت خود خبری را منتشر نکرد اما نوشت که این پرونده با شکایت مشترک سازمان اطلاعات سپاه پاسداران انقلاب اسلامی، وزارت اطلاعات، معاون دادستان تهران و دادستانی قم تشکیل شد.
دهباشی افزود: «محکوم شدم بابت آن‌ نوبت که نوشتم چرا قم را قرنطینه نکردید. دست‌شان درد نکند. اما واقعا لشکرکشی نمی‌خواست، شکایت یک‌کدام‌شان هم کافی بود.»
حسین دهباشی اسفند سال ۱۳۹۸ که دوران آغازین شیوع کرونا در ایران بود، در یک توییت نوشته بود: «تاریخ را فاتحان می‌نویسند اما سهم من هم باشد این گواهی به آیندگان که اگر بعدها پرسیدند چرا ۲۲ استان از این گربه مظلوم جغرافیا چنین تا پای مرگ بیمار شد، نوشته باشم به خاطر خودخواهی آخوندهایی که به اعتبار عمامه‌هایشان روز گفتند و نگذاشتند قم قرنطینه شود.»
طبق اعلام معاون وزیر بهداشت، درمان و آموزش پزشکی، ویروس کرونا اولین بار از شهر قم و به واسطه شهروندان چینی که در این شهر زندگی می‌کنند، وارد ایران شد. در همان زمان، کاربران زیادی در شبکه‌های اجتماعی خواستار قرنطینه کامل شهر قم برای مقابله با انتشار کرونا در سراسر ایران شده بودند اما این درخواست با مخالفت روحانیون سرشناس این شهر مذهبی مواجه شد.

سوابق حرفه ای حسین دهباشی

این  تاریخ‌پژوه، مستندساز و فعال رسانه‌ای پیش‌تر به خاطر ساخت مستندهای تبلیغاتی «حسن روحانی» در یازدهمین انتخابات ریاست جمهوری و نیز مستند «به روایت دربار» شناخته شده ‌است.

او در سال ۱۳۹۲ مشاور رسانه‌ای حسن روحانی بود اما به مرور به یکی از منتقدان او تبدیل شد.

این مستندساز در سال‌های اخیر مجموعه‌ای به نام «خشت خام» را ساخته که از اینترنت پخش می‌شود. در این مجموعه او با افراد صاحب‌نام درباره حوزه‌های مختلف تاریخ به گفت‌وگو نشسته است که از لابه‌لای سوال و جواب‌ها بخشی از تاریخ مستند ایران روایت می‌شود.  او در این مجموعه با شخصیت‌های سیاسی از جمله «فائزه هاشمی رفسنجانی»، «سید ابوالحسن بنی‌صدر»، «صادق زیباکلام»، «حمید رسایی»، «مصطفی تاج‌زاده» و «ابراهیم یزدی» گفت‌وگو داشته است. 

حسین دهباشی تاکنون کتاب‌ها و مستندهای زیادی نوشته و ساخته است.

آقای دهباشی با صدا و سیمای جمهوری اسلامی و برخی رسانه های ایرانی نیز سابقه همکاری داشته است.